驚いた地元の農民と消費者たちは野外実験の中止を強く求めました。センターが植えたのは、「コシヒカリ」系統の米「どんとこい」に、病害に強いカラシナの遺伝子を導入したいもち病などに強いイネで減農薬になるというふれこみです。
しかし、これまでのイネ同士を交配させる育種方法で病気に強い品種は作り出されていて、わざわざ不確実な遺伝子操作技術を使う必要はまったくありません。それより米どころでの風評被害や、ＧＭイネの花粉が飛んで、周辺の田んぼのイネと交雑すれば、遺伝子汚染は避けられません。そうなったら、取り返しがつかなくなります。
地元の有機生産者や農民団体、消費者が再三の中止申し入れ、抗議集会、署名提出を行なったにもかかわらず反対を押し切って第1回の田植えが5月31日に強行されました。
この第１回田植えは、いもち病耐性の実効性を見るのが目的の実験のため、穂が出る前に刈り取るというものでした。しかし、第２回目の田植えのＧＭイネは実らせ種を取って次年度の実験用にするとの説明。その田植えが6月末と発表され、新潟の環境や米を食べる人の安全、そして未来への責任の観点からもこれを見過ごしにすることはできない、なんとしてもこれを止めさせなければと実験の差し止めを求める仮処分裁判を起こしたのです。
原告となったのは、消費者、生産者総勢12名（後にセンターに最も近い田んぼを持つ農家も加わり13名となった）です。6月24日に申立を新潟地裁高田支部に行ないました。
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